O LPF é composto por três Gerências: de Pesquisa, de Desenvolvimento e de Administração e Finanças, responsáveis pelas atividades de pesquisa científica e tecnológica, de desenvolvimento e de gestão administrativa e financeira, respectivamente.

 
    - Laboratório de Produtos Florestais - LPF
        - Divisão de Pesquisa & Desenvolvimento
            - Anatomia e Morfologia
            - Engenharia e Física
            - Energia da Biomassa
            - Preservação e Biodegradação
            - Produtos e Processos
            - Secagem
            - Química, Adesivos e Borracha Natural
            - Usinagem
        - Divisão de Desenvolvimento Institucional
            - Comitê da Qualidade
            - Documentação e Informação
            - Estatística e computação
        - Divisão de Administração e Finanças
            - Secretaria
            - Serviços Gerais
            - Compras e Licitação